Вірус мозаїки томатів (ВМТо) викликає контагіозні захворювання овочевих культур, а у випадку контамінації насіння і повну втрату врожаю. Метою роботи було встановлення філогенетичної спорідненості українських ізолятів ВМТо, виділених з рослин томатів, звідомими ізолятами шляхом порівняння гена капсидного білка. Методи: ІФА, електронна мікроскопія, ЗТ-ПЛР, аналіз нуклеотидного сиквенсу за допомогою програми MEGA 5. Сиквеновані нуклеотид- ні послідовності капсидного білка двох нових українських ізолятівToMV-ukr-5 і ToMV-ukr-10 були порівнянні між собою та з відомими ізолятами ВМТо. Побудова філогенетичного дерева дозволила об"єднати досліджувані штами та ізо- ляти ToMV у два окремі кластери. Ізоляти ToMV-ukr-5 та ToMV-ukr-10 увійшли до першого кластера разом з ще 28 досліджуваними ізолятами, відсоток гомології у яких з українськими ізолятами становив 96-98,9 %. У межах першого кластера чітко виділяються два субкластери: до першого входять ізоляти, відсоток гомології яких з українськими ізолятами становить більше 96,7 %, а до другого - три штами та ізоляти з відсотком гомології 96,1 % відносно українських ізолятів: ізолят SL-1, штам camellia та ізолят Dahlemense DSMZ PV-0135. Два ізоляти вірусу мозаїки томатів ToMV-ukr-5 і ToMV-ukr-10 були виділен&і з рослин томатів відкритого грунту різних регіонів України. У філогенетичному аналізі показано високу спорідненість українських ізолятів між собою і з уже відомими штамами та ізолятами цього вірусу за геном капсидного білка. Найбільш високий відсот&ок гомології (>98 %) українські ізоляти мали з бразильським ізолятом Hemerocallis, китайським ізолятом G2 та томатними ізолятами AH4, Queensland, ToMV-tom і Ls-K, S14 та FERA_160205. Гомологія ізолятів простежувалась незалежно від джерела виділення в&ірусу, виду рослини-хазяїна та їх географічного поширення.
Вирус мозаики томатов (ВМТо) вызывает контагиозные заболевания овощных культур, а при контаминации семян и полную потерю урожая. Целью данной работы было изучение филогенетического родства у&краинских изолятов ВМТо, выделенных из растений томата, с другими известными изолятами ВМТо путем сравнения нуклеотидной последовательности гена капсидного белка вируса. Методы: ИФА, электронная микроскопия, ОТ-ПЦР, анализ нуклеотидных последовательн&остей с помощью программного пакета MEGA 5, статистические методы. кДНК двух новых украинских изолятов ToMV-ukr-5 и ToMV-ukr-, соответствующие гену капсидного белка, были секвенированы, после чего их сравнивали между собой и с другими известными изол&ятами ВМТо. Построение филогенетического дерева позволило объединить исследуемые изоляты ВМТо в два отдельных кластера. Вместе с новыми украинскими изолятами ToMV-ukr-5 и ToMV-ukr-10 к первому кластеру отнесены еще 28 исследуемых изолятов, на 96-98,9& % идентичные украинским. В пределах первого кластера четко выделялись два субкластера: в первый вошли изоляты, гомологичные украинским более чем на 96,7 %; а во второй - три изолята с уровнем гомологии 96.1 % (томатный изолят SL-1, штамм camellia и &изолят Dahlemense DSMZ PV-0135). Выводы: Два новых украинских изолята ToMV-ukr-5 и ToMV-ukr-10 были выделены из томата в условиях открытого грунта в разных регионах Украины. Филогенетический анализ подтвердил высокое родство украинских изолятов между& собой, а также с другими изолятами этого вируса. Украинские изоляты ToMV-ukr-5 и ToMV-ukr-10 наиболее подобны (> 98 %) бразильскому изоляту Hemerocallis, китайскому изоляту G2 и следующим томатным изолятам: AH4, Queensland, ToMV-tom и Ls-K, S14 и FE&RA_160205. Высокий уровень гомологии исследуемых изолятов не зависел от источника вируса, растения-хозяина и их географического распространения.
Tomato mosaic virus (ToMV) induces highly infectious disease of vegetables, whereas use of virus-contami&nated seed may lead to complete yield loss. This work was aimed at studying phylogenetic relationships of Ukrainian tomato isolates of ToMV with its known isolates by comparing nucleotide sequence of coat protein gene. ELISA, TEM, RT-PCR, sequence an&
З 31.12.2014 по 01.03.2015 Наукова бібліотека читачів не обслуговує.
