Описано запропонований підхід до проектування та розроблення інформаційних систем для оптимізації структури та автоматизації управління вищим навчальним закладом - систем формування обсягу навчального навантаження кафедр та систем управління розподілом ставок заробітної плати професорсько-викладацького складу. Проведено огляд проблем побудови та вдосконалення структури ключових процесів управління вищим навчальним закладом. Запропоновано метод побудови дискретної моделі структури управління процесами формування обсягу навчального навантаження кафедр та управління розподілом ставок заробітної плати професорсько-викладацького складу. Описано спроектовані та програмно реалізовані інформаційні системи.