Influenza remains a serious problem for the world. The accumulation of genetic changes (mutations) in influenza viruses leads to changes in their antigenic properties, the emergence of strains resistant to antiviral drugs and the emergence of new epidemics. The aim of recent study was to perform the phylogenetic analysis of neuraminidase gene of influenza A(H3N2) viruses isolated in Ukraine in 2013-2014 season. Methods. Molecular genetics, phylogenetic and statistical methods were used for this study. Results. High (94%) genetic similarity of Ukrainian isolates and isolates from other countries of 2013-2014 epidemic seasons demonstrates the stability of viral populations in Ukraine. The allocation of Ukrainian viruses to three different clusters points to different ways of their spread to Ukraine. The analysis of NA sequences revealed novel amino acid substitutions Y155F, D251V, S315G to the majority of Ukrainian isolates. None of virus isolates of season 2013-2014 in Ukraine contained an E119D mutation in NA sequence which is associated with oseltamivir resistance. Conclusions. The results of our work showed that influenza viruses isolated in 2013-2014 epidemic season had not specific mutations, associated with resistance to antiviral drugs such& as oseltamivir.
Метою даної роботи було проведення філогенетичного аналізу генів нейрамінідази вірусів грипу A(H3N2), виділених в Україні в 2013-2014 сезоні. Методи. В роботі були використані методи молекулярної генетики, філогенії та математичної &статистики. Результати. Висока (94%) генетична подібність українських ізолятів, виділених під час епідемічного сезону в інших країнах свідчить про стабільність вірусної популяції в Україні. Розміщення українських ізолятів вірусів грипу у трьох різних& кластерах свідчить про різні шляхи занесення вірусів на територію України. Аналіз послідовностей NA виявив у більшості українських ізолятів нові заміщення амінокислот у положеннях Y155F, D251V, S315G. Жоден із досліджуваних ізолятів вірусу грипу не& містив в послідовності NA мутації E119D, яку асоціюють із резистентністю до озельтамівіру. Більшість випадків респіраторних захворювань людини спричинені вірусами. Поверхневі глікопротеїни вірусу грипу є високо варіабельними, внаслідок чого здатні у&никати впливу імунної системи господаря. Дослідження генетичних змін серед всіх штамів вірусів грипу є важливим для визначення походження сегментів РНК вірусів грипу A(H3N2) від одного чи декількох різних господарів. Застосування філогенетичного анал&ізу дозволяє проводити моніторинг рівня та напрямку мінливості вірусів грипу практично у реальному часі. Більш того, порівняння амінокислотних послідовностей робить можливим виявлення початку нових заміщень та спостерігати механізми адаптації вірусу &до імунної системи людини. Зазвичай для філогенетичного аналізу використовують послідовності поверхневих антигенів - гемаглютиніну (HA) та нейрамінідази (NA). Метою нашої роботи було провести філогенетичний аналіз послідовностей NA вірусів грипу A(H3&N2), виділених в Україні в 2013-2014 сезоні.
