Стаття присвячена аналізу механізму взаємодії інноваційних систем
України та країн Європейського Союзу на основі структурного взаємодоповнення. Інноваційна система ЄС орієнтована за своєю структурою на розвиток міжнародного науково-технічного співробітництва. За останні роки ЄС постійно активізує шляхи
пошуку співробітництва з Україною і тому це обумовлює необхідність дослідження особливостей формування інноваційних систем ЄС, урахування змін, що відбуваються у наднаціональній інноваційній політиці. Більш того, досвід ЄС в розвитку міжнародної
науково-технічної інтеграції є унікальним та повинен використовуватись в Україні. Основною задачею інноваційної політики ЄС є ліквідація різних проявів фрагментації. Інноваційна система ЄС має багатошаровий та багаторівневий характер та має можливість вбудовуватись у глобальну інноваційну систему шляхом співробітництва з третіми країнами. У процесі реалізації політичної частини Угоди про асоціацію між Україною та ЄС та наступного підписання Угоди про посилену зону вільної торгівлі будуть уточнюватися механізми інноваційної взаємодії між двома сторонами.