В статье анализируются недостатки организационных преобразований в сфере научных исследований в России. На основе опыта стран ОЭСР и отечественных реалий, а также с учетом дискуссий в научных кругах предлагаются альтернативные меры. Среди этих мер выделяются отказ от стимулирования НИОКР во второстепенных вузах и организационная модернизация Российской академии наук. Особое внимание уделено учету специфики отдельных наук при оценке их текущего состояния в России и разработке шагов по повышению их международной конкурентоспособности.