Krasnikova M., Ozerova L., Troitsky A., Solovyev A., Morozov S.
Назва:
Peculiarities of phylogeny and expression of TAS3-like small RNA precursor genes in plants belonging to family Asteraceae: experimental approach and bioinformatics analysis
Используя разработанную ранее нами методику для детекции и клонирования генов малых транс-действующиих интерферирующих РНК (TAS3 генов), мы показали, что во взрослых растениях трех видов родов Curio и Senecio происходит экспрессия только одного типа TAS3 генов. Более того, анализ баз данных последовательностей кДНК у других родов в семействе Asteraceae также показал преимущественную экспрессию только одного TAS гена, названного нами TAS3-Sen1 и проявляющего значительную межвидовую гомологию в пределах этого семейства. Более того, при транскрипции гена TAS3-Sen1 у растений рода Senecio образуется не единственная РНК (первичный транскрипт ta-siRNA), а набор РНК за счет преждевременной терминации транскрипции внутри гена TAS3-Sen1. Обнаружение нами в составе наиболее протяженного TAs3-Sen1 РНК-транскрипта повторяющейся последовательности (GA)n, учитывая данные литературных источников, позволяют предположить ее участие в синтезе недостроенных транскриптов.
In this paper, we have studied the presence of tasiARF RNA genes in the representatives of genus Seneciohaving either uni- facial or true bifacial leaves. It was found that both types of species encode such RNA precursors principally similar to those found in Arabidopsis. We used primers mimicking& miR390 and oligo (dT)-based oligonucleotides. One of the TAS3 species (TAS3-Sen1) in Senecio representatives was actively transcribed and distributed among many Asteracea plants and found to be similar to AtTAS3a. The data obtained may contribute to& understanding of expression regulation of Senecio TAS3-like genes and the potential involvement of these RNAs in development of plant organ abaxial-adaxial symmetry.
