Досліджено конформаційні зміни, що відбуваються у тропоніні С серцевого м"яза курчати при вивільненні іону кальцію
з білка в наносекундному інтервалі методом молекулярної динаміки. Порівняльний аналіз отриманих результатів і експериментальних даних рентгеноструктурного аналізу, ядерного магнітного резонансу, флуоресцентної спектроскопії
та нейтронного розсіювання показав значну точність і адекватність розрахунків. Показано, що при вивільненні іона Са2+ збільшуються повздовжні розміри тропоніну С, відбувається переорієнтація ?-спіралей N-домену та спостерігається тенденція до закривання гідрофобної кишені.
Conformational changes of chicken cardiac troponin C caused by calcium release from protein have been investigated in nanosecond interval usingmolecular dynamics simulations. Comparative analysis of obtained results and experimental data of X-ray crystallography, nuclear magnetic resonance, fluorescence spectroscopy and neutron scattering has shown adequate accuracy of calculations. It is shownthat release of calcium leads to increase of longitudal size of troponin C, reorientation of ?-helixes of N-domain and closing of hydrophobic pocket.
